Også her er hygiejnen meget vigtig. Derfor skal man naturligvis rengøre sine flasker, inden man hælder den færdige øl i. Man kan med fordel skylle sine flasker med koldt vand, lige så snart de er tømt for øl. Det gør rengøringen meget nemmere, når de endelig skal bruges til din egen hjemmebryggede øl.
Flasker skylles med kemikalier egnet til formålet umiddelbart inden øllen kommer i. Jeg bruger 35% brintoverilte, som nedvandes. Alle flasker skylles i opløsningen og placeres i kassen med bunden i vejret, indtil øllen hældes på.
Jeg bruger primært flasker på 33 cl. med patentprop fra Flensburger, og flasker på 50 cl. med kapsel, som men kender det fra blandt andet tyske hvedeøl.